大豆期货设置两个合约的原因：

1、两个期货品种合约的并行，能够更好的完善我们国家大豆期货的品种体系。两品种并行执行，使国内非转基因大豆和榨取公司广泛应用的非转基因和转基因混合大豆都有了各自的价格形成中心。

2、有利于建立大豆销售市场完备的价格政策，使国内非转基因大豆和混和大豆的产品差别、价值体现更为科学合理，更为有力地引导国内大豆生产向高蛋白和高油方向发展，促进农民增收。

3、豆一和豆二的并驾齐驱也帮助了非转基因大豆和混合大豆的使用者，为他们提供了完善的避险系统，企业可以根据自身经营状况选择不同的避险市场。

豆一、豆二期货合约的不同点：

1、种类不一样：豆一和豆二归属于期货交易里的两个不同交易品种。豆一交易品种是非转基因大豆，豆二买卖交易品种是转基因和非转基因大豆；

2、期货合同的定价方式不同：豆一的合同价格会包括所有包装物品，豆二不包括包装物品的价格；

3、包装不同：豆一般只用袋装包装，豆二则用散装和袋装组合。